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As of 21-Sep-2022 number of released structures: 12282
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NDB ID: 7EDT  PDB ID: 7EDT 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
7EDT|1|A|A|37EDT|1|A|C|4s35
7EDT|1|A|A|37EDT|1|A|G|2s53
7EDT|1|A|A|37EDT|1|B|C|23s55
7EDT|1|A|C|117EDT|1|A|C|110BPh
7EDT|1|A|C|117EDT|1|A|C|12s35
7EDT|1|A|C|117EDT|1|B|G|14cWW
7EDT|1|A|C|127EDT|1|A|C|11s53
7EDT|1|A|C|127EDT|1|A|C|120BPh
7EDT|1|A|C|127EDT|1|B|G|13cWW
7EDT|1|A|C|127EDT|1|B|G|14s55
7EDT|1|A|C|47EDT|1|A|A|3s53
7EDT|1|A|C|47EDT|1|A|C|40BPh
7EDT|1|A|C|47EDT|1|A|U|5s35
7EDT|1|A|C|47EDT|1|B|G|21cWW
7EDT|1|A|C|67EDT|1|A|C|7ns35
7EDT|1|A|C|67EDT|1|A|U|5s53
7EDT|1|A|C|67EDT|1|B|C|18s33
7EDT|1|A|C|67EDT|1|B|C|19tWHn6BP
7EDT|1|A|C|67EDT|1|B|G|20s55
7EDT|1|A|C|77EDT|1|A|C|6ns53
7EDT|1|A|C|77EDT|1|A|C|70BPh
7EDT|1|A|C|77EDT|1|A|G|8s35
7EDT|1|A|C|77EDT|1|B|C|18ntHS
7EDT|1|A|G|17EDT|1|A|G|1n0BP
7EDT|1|A|G|17EDT|1|A|G|2s35
7EDT|1|A|G|17EDT|1|B|C|24cWW
7EDT|1|A|G|27EDT|1|A|A|3s35
7EDT|1|A|G|27EDT|1|A|G|1s53
7EDT|1|A|G|27EDT|1|A|G|20BPh
7EDT|1|A|G|27EDT|1|B|C|23cWW
7EDT|1|A|G|27EDT|1|B|C|24s55
7EDT|1|A|G|87EDT|1|A|C|7s53n0BP
7EDT|1|A|G|87EDT|1|A|G|80BPh
7EDT|1|A|G|87EDT|1|A|G|9s35
7EDT|1|A|G|87EDT|1|B|C|18s55
7EDT|1|A|G|87EDT|1|B|U|17cWW
7EDT|1|A|G|97EDT|1|A|G|8s53
7EDT|1|A|G|97EDT|1|A|G|90BPh
7EDT|1|A|G|97EDT|1|B|C|16cWW
7EDT|1|A|G|97EDT|1|B|U|17s55
7EDT|1|A|U|57EDT|1|A|C|4s53
7EDT|1|A|U|57EDT|1|A|C|6s35
7EDT|1|A|U|57EDT|1|A|U|50BPh
7EDT|1|A|U|57EDT|1|B|G|20cWW
7EDT|1|A|U|57EDT|1|B|G|21s55
7EDT|1|B|A|157EDT|1|B|A|150BPh
7EDT|1|B|A|157EDT|1|B|C|16s35
7EDT|1|B|A|157EDT|1|B|G|14s53
7EDT|1|B|C|167EDT|1|A|G|9cWW
7EDT|1|B|C|167EDT|1|B|A|15s53
7EDT|1|B|C|167EDT|1|B|C|160BPh
7EDT|1|B|C|167EDT|1|B|U|17s35
7EDT|1|B|C|187EDT|1|A|C|6s33
7EDT|1|B|C|187EDT|1|A|C|7ntSH
7EDT|1|B|C|187EDT|1|A|G|8s55
7EDT|1|B|C|187EDT|1|B|C|180BPh
7EDT|1|B|C|187EDT|1|B|U|17s53
7EDT|1|B|C|197EDT|1|A|C|6tHW
7EDT|1|B|C|197EDT|1|B|C|18
7EDT|1|B|C|197EDT|1|B|C|190BPh
7EDT|1|B|C|197EDT|1|B|G|20s35
7EDT|1|B|C|237EDT|1|A|A|3s55
7EDT|1|B|C|237EDT|1|A|G|2cWW
7EDT|1|B|C|237EDT|1|B|C|230BPh
7EDT|1|B|C|237EDT|1|B|C|24s35
7EDT|1|B|C|247EDT|1|A|G|1cWW
7EDT|1|B|C|247EDT|1|A|G|2s55
7EDT|1|B|C|247EDT|1|B|C|23s53
7EDT|1|B|C|247EDT|1|B|C|240BPh
7EDT|1|B|G|137EDT|1|A|C|12cWW
7EDT|1|B|G|137EDT|1|B|G|13n0BP
7EDT|1|B|G|137EDT|1|B|G|14s35
7EDT|1|B|G|147EDT|1|A|C|11cWW
7EDT|1|B|G|147EDT|1|A|C|12s55
7EDT|1|B|G|147EDT|1|B|A|15s35
7EDT|1|B|G|147EDT|1|B|G|13s53
7EDT|1|B|G|147EDT|1|B|G|140BPh
7EDT|1|B|G|207EDT|1|A|C|6s55
7EDT|1|B|G|207EDT|1|A|U|5cWW
7EDT|1|B|G|207EDT|1|B|C|19s53
7EDT|1|B|G|207EDT|1|B|G|200BPh
7EDT|1|B|G|207EDT|1|B|G|21s35
7EDT|1|B|G|217EDT|1|A|C|4cWW
7EDT|1|B|G|217EDT|1|A|U|5s55
7EDT|1|B|G|217EDT|1|B|G|20s53
7EDT|1|B|G|217EDT|1|B|G|210BPh
7EDT|1|B|U|177EDT|1|A|G|8cWW
7EDT|1|B|U|177EDT|1|A|G|9s55
7EDT|1|B|U|177EDT|1|B|C|16s53
7EDT|1|B|U|177EDT|1|B|C|18s35
7EDT|1|B|U|177EDT|1|B|U|170BPh


Base-PairsCount (9)Relative Frequency
cWW80.889
tWH10.111
Base-PhosphateCount (18)Relative Frequency
0BPh181.000
Base-StackingCount (12)Relative Frequency
s3310.083
s5340.333
s5570.583

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)