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NDB ID: 7EI5  PDB ID: 7EI5 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
7EI5|1|A|A|107EI5|1|A|A|10n0BP
7EI5|1|A|A|107EI5|1|A|A|11cSH
7EI5|1|A|A|107EI5|1|A|U|9s53
7EI5|1|A|A|117EI5|1|A|A|10cHS
7EI5|1|A|A|117EI5|1|A|A|110BPh
7EI5|1|A|A|117EI5|1|A|G|12s35
7EI5|1|A|A|157EI5|1|A|A|150BPh
7EI5|1|A|A|157EI5|1|A|C|14s53
7EI5|1|A|A|157EI5|1|A|U|16s35
7EI5|1|A|A|187EI5|1|A|A|180BPh
7EI5|1|A|A|187EI5|1|A|A|19s35
7EI5|1|A|A|197EI5|1|A|A|18s53
7EI5|1|A|A|197EI5|1|A|A|190BPh
7EI5|1|A|A|197EI5|1|A|A|20s35
7EI5|1|A|A|197EI5|1|A|G|17ns33
7EI5|1|A|A|27EI5|1|A|A|2n0BP
7EI5|1|A|A|27EI5|1|A|C|1s53
7EI5|1|A|A|27EI5|1|A|G|3s35
7EI5|1|A|A|207EI5|1|A|A|19s53
7EI5|1|A|A|207EI5|1|A|A|200BPh
7EI5|1|A|A|207EI5|1|A|G|17tHS
7EI5|1|A|A|57EI5|1|A|A|50BPh
7EI5|1|A|A|57EI5|1|A|C|4s53
7EI5|1|A|A|57EI5|1|A|G|6s35
7EI5|1|A|C|17EI5|1|A|A|2s35
7EI5|1|A|C|17EI5|1|A|C|10BPh
7EI5|1|A|C|147EI5|1|A|A|15s35
7EI5|1|A|C|147EI5|1|A|C|140BPh
7EI5|1|A|C|147EI5|1|A|G|13s53
7EI5|1|A|C|47EI5|1|A|A|5s35
7EI5|1|A|C|47EI5|1|A|C|40BPh
7EI5|1|A|C|47EI5|1|A|G|3s53
7EI5|1|A|C|87EI5|1|A|C|80BPh
7EI5|1|A|C|87EI5|1|A|G|7s53
7EI5|1|A|C|87EI5|1|A|U|9s35
7EI5|1|A|G|127EI5|1|A|A|11s53
7EI5|1|A|G|127EI5|1|A|G|120BPh
7EI5|1|A|G|127EI5|1|A|G|13s35
7EI5|1|A|G|137EI5|1|A|C|14s35
7EI5|1|A|G|137EI5|1|A|G|12s53
7EI5|1|A|G|137EI5|1|A|G|130BPh
7EI5|1|A|G|177EI5|1|A|A|19ns33
7EI5|1|A|G|177EI5|1|A|A|20tSH3BPh
7EI5|1|A|G|177EI5|1|A|G|170BPh
7EI5|1|A|G|177EI5|1|A|U|16s53
7EI5|1|A|G|37EI5|1|A|A|2s53
7EI5|1|A|G|37EI5|1|A|C|4s35
7EI5|1|A|G|37EI5|1|A|G|30BPh
7EI5|1|A|G|67EI5|1|A|A|5s53
7EI5|1|A|G|67EI5|1|A|G|60BPh
7EI5|1|A|G|67EI5|1|A|G|7s35
7EI5|1|A|G|77EI5|1|A|C|8s35
7EI5|1|A|G|77EI5|1|A|G|6s53
7EI5|1|A|G|77EI5|1|A|G|70BPh
7EI5|1|A|U|167EI5|1|A|A|15s53
7EI5|1|A|U|167EI5|1|A|G|17s35
7EI5|1|A|U|167EI5|1|A|U|160BPh
7EI5|1|A|U|97EI5|1|A|A|10s35
7EI5|1|A|U|97EI5|1|A|C|8s53
7EI5|1|A|U|97EI5|1|A|U|90BPh


Base-PairsCount (2)Relative Frequency
cHS10.500
tHS10.500
Base-PhosphateCount (19)Relative Frequency
3BPh10.053
0BPh180.947
Base-StackingCount (8)Relative Frequency
s5381.000

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)